miRNA 靶基因预测介绍
2014-01-07 MedSci MedSci原创
miRNA主要通过与靶mRNA的结合，或促使mRNA降解，或阻碍其翻译，从而抑制目的基因的表达。用生物信息学方法准确快速地预测miRNA的靶基因，可以为研究miRNA功能提供线索。 植物miRNA 靶基因的预测比较简单, 因为在植物中miRNA与靶基因几乎以完全互补配对的方式结合, 预测时无需复杂的算法。 计算方法的预测主要依赖于已经验证的miRNA和靶基因间的结合的规律。主要原则有：
miRNA主要通过与靶mRNA的结合，或促使mRNA降解，或阻碍其翻译，从而抑制目的基因的表达。用生物信息学方法准确快速地预测miRNA的靶基因，可以为研究miRNA功能提供线索。 植物miRNA 靶基因的预测比较简单, 因为在植物中miRNA与靶基因几乎以完全互补配对的方式结合, 预测时无需复杂的算法。 计算方法的预测主要依赖于已经验证的miRNA和靶基因间的结合的规律。主要原则有：miRNA 与其靶位点在种子区域互补；miRNA 靶位点在不同物种之间保守； miRNA-mRNA 双链之间的热力学稳定性好； miRNA 靶位点处不应有复杂二级结构；miRNA 5′ 端与靶基因的结合能力强于3′端。还有其它原则如多个靶位点现象的存在等。 十年来开发出的miRNA 靶基因预测软件很多，一些软件的推出时间见下图所示。 几种常见的预测软件有： 1). miRanda. 它是最早的miRNA靶基因预测软件。它对3′UTR 的筛选依据主要是序列匹配、miRNA 与mRNA 双链的热稳定性以及靶位点的跨物种保守性。适用范围广泛。对于潜在的杂交位点，miRanda也给予打分。m
本网站所有内容来源注明为“williamhill asia 医学”或“MedSci原创”的文字、图片和音视频资料，版权均属于williamhill asia 医学所有。非经授权，任何媒体、网站或个人不得转载，授权转载时须注明来源为“williamhill asia 医学”。其它来源的文章系转载文章，或“williamhill asia 号”自媒体发布的文章，仅系出于传递更多信息之目的，本站仅负责审核内容合规，其内容不代表本站立场，本站不负责内容的准确性和版权。如果存在侵权、或不希望被转载的媒体或个人可与williamhill asia 联系，williamhill asia 将立即进行删除处理。
在此留言
#miR#
47
#miRNA#
47
#靶基因#
56