《新英格兰杂志》：英国和爱尔兰万人队列的儿科罕见病基因组诊断研究
2023-05-09 田医生 MedSci原创 发表于上海
二代基因测序（Next-generation sequencing，NGS）技术极大地提高了儿童罕见病患者获得准确基因诊断的可能，通过对患者基因组中每一个基因同时进行检测，获得患者身上携带的
二代基因测序（Next-generation sequencing，NGS）技术极大地提高了儿童罕见病患者获得准确基因诊断的可能，通过对患者基因组中每一个基因同时进行检测，获得患者身上携带的绝大多数重要变异，从而有可能对一系列临床表型进行精确诊断。
目前世界各地的诊断研究团队都在开展基因组研究，将大规模基因组研究与个体患者反馈相结合的首批研究之一就是解密发育障碍（Deciphering Developmental Disorders，DDD）研究，该研究团队的最新研究结果日前发表在《新英格兰杂志》。
研究团队对来自于英国和爱尔兰24个地区遗传服务机构的13500多名难以诊断的严重发育障碍患者家庭（可能是单基因病因）进行基因测序研究。
通过标准化的收集患者及家庭表型数据，进行外显子组测序和微阵列分析来研究新的遗传病因。团队建立了一个迭代变异分析流程，并向临床医生报告候选变异，以进行验证和诊断解释，从而为与家属的沟通提供信息。
DDD研究团队最终共纳入13449名先证者进行分析，为其中大约41%的前期未能明确病因的患者确定了遗传病因。研究团队认为全基因组数据的多模态分析具有良好的诊断能力，万余人队列的临床实践应用，证明了基因组诊断结合临床表型分析的方法可提升遗传诊断率。
参考文献：
Wright CF, Campbell P, Eberhardt RY, Aitken S, Perrett D, Brent S, Danecek P, Gardner EJ, Chundru VK, Lindsay SJ, Andrews K, Hampstead J, Kaplanis J, Samocha KE, Middleton A, Foreman J, Hobson RJ, Parker MJ, Martin HC, FitzPatrick DR, Hurles ME, Firth HV; DDD Study. Genomic Diagnosis of Rare Pediatric Disease in the United Kingdom and Ireland. N Engl J Med. 2023 Apr 27;388(17):1559-1571. doi: 10.1056/NEJMoa2209046. Epub 2023 Apr 12. PMID: 37043637; PMCID: PMC7614484.
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