Sci Rep：在间叶细胞区中能够调控前列腺器官生成基因表达的鉴定
2017-12-14 AlexYang MedSci原创
前列腺器官生成包括了上皮的生长，并且受特异的间叶细胞区诱导信号控制。最近，有研究人员为了鉴定间质区域中通路的活性，利用了组织和单细胞测序明确了间叶细胞区域和区域特异性转录本的表达，并且还利用了Tag-seq和RNA-seq技术在雌性小鼠的腹侧间质细胞区（VMP）和临近的尿道，包括平滑肌和尿道周的间充质中阐释了转录本的表达情况。转录本在雌性VMP中的丰度是通过显微切割组织的Tag-seq、细胞群体和
前列腺器官生成包括了上皮的生长，并且受特异的间叶细胞区诱导信号控制。最近，有研究人员为了鉴定间质区域中通路的活性，利用了组织和单细胞测序明确了间叶细胞区域和区域特异性转录本的表达，并且还利用了Tag-seq和RNA-seq技术在雌性小鼠的腹侧间质细胞区（VMP）和临近的尿道，包括平滑肌和尿道周的间充质中阐释了转录本的表达情况。转录本在雌性VMP中的丰度是通过显微切割组织的Tag-seq、细胞群体和单细胞的RNA-seq来鉴定的。
研究人员发现，利用生物信息学对Tag-seq和RNA-seq数据的比较，鉴定了400个转录本在VMP中是丰富的，还有44是通过单细胞RNA-seq来确定的。细胞子集分析表明了VMP和临近的间充质是由不同的细胞类型组成，并且每个组织包含了2个亚群。这些亚群的标记是具有高度子集特异性的。另外，有13个转录本是通过qPCR技术来确定的，从而来确认在显微切割组织中以及新生儿前列腺中的细胞的特异性表达。免疫组化染色表明，Ebf3和Meis2在雌性VMP和前列腺间充质中展现出了限制表达模式。最后，研究人员指出，前列腺诱导的间充质表现出了有限的细胞学异质性，并且转录组分析鉴定了与前列腺器官生成的新的间叶细胞区域转录本。
原始出处：
Nadia Boufaied， Claire Nash， Annie Rochette et al. Identification of genes expressed in a mesenchymal subset regulating prostate organogenesis using tissue and single cell transcriptomics. Sci Rep. 27 Nov 2017.
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#基因表达#
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非常好的文章.学习了
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