破局NSCLC患者EGFR-TKI耐药后MET扩增第一步,合适的检测方法很重要!
2024-05-16 e路新干线 e路新干线 发表于上海
该分析表明,相比于FISH,DNA NGS对于MET扩增的检出率低,特异性高但灵敏度相对较低,即可能会有一部分MET扩增的患者无法通过DNA NGS检出。
前 言
目前表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)已经成为EGFR突变NSCLC患者的标准治疗选择,但耐药不可避免。MET扩增是EGFR-TKI靶向治疗重要的耐药机制之一,多项临床试验数据表明,EGFR-TKI耐药伴MET扩增晚期NSCLC患者可从MET抑制剂治疗中获益1,2。NCCN威廉亚洲博彩公司 和CSCO威廉亚洲博彩公司 已将MET扩增列入推荐检测的项目3,4,目前针对MET扩增的检测方法主要包括荧光原位杂交(FISH)和DNA二代测序(DNA NGS),但两种方法检测结果的一致性有待研究。
山东省肿瘤医院放疗科的朱慧教授和杨正强教授进行了34例EGFR-TKI耐药NSCLC患者组织样本NGS和FISH检测结果的一致性比较,为EGFR突变患者耐药后检测方法的选择提供了参考。
主要内容
方法
纳入的患者为第一/二/三代EGFR-TKI耐药的晚期NSCLC,获取其组织样本后,采用NGS和FISH两种方法分别检测MET扩增情况。NGS检测MET扩增的判读标准为CN>2(参考山东省肿瘤医院基因检测报告中对于拷贝数变异的阈值标准);FISH检测MET扩增的判读标准为:GCN≥5或MET/CEP7≥2,局部扩增定义为MET/CEP7≥2,多体定义为MET GCN≥5且MET/CEP7<2(参考《非小细胞肺癌MET临床检测中国专家共识》5)。
结果
收集了2022年4月15日至2023年11月6日至山东省肿瘤医院就诊的34例EGFR-TKI耐药且均进行了NGS和FISH检测的患者数据,其中32例患者(94.1%)为腺癌;8例患者(23.5%)使用第一代或第二代EGFR-TKI后耐药,26例患者(76.5%)使用第三代EGFR-TKI后耐药。结果见表1。
表1.基线特征
通过NGS方法(组织样本)检测出5例患者存在MET扩增。其中4例患者为第三代EGFR-TKI(奥希替尼或阿美替尼)耐药,1例为第二代EGFR-TKI(阿法替尼)耐药。
通过FISH方法检测出10例患者存在MET扩增,9例患者为局部扩增,1例为多体。其中7例患者为第三代EGFR-TKI(奥希替尼或阿美替尼)耐药,3例为第二代EGFR-TKI(阿法替尼)耐药。结果见表2。
表2.MET扩增患者基本情况
进行NGS和FISH检测结果的一致性比较,5例经NGS检测为MET扩增(NGS+)的患者,4例FISH结果为MET扩增(FISH+),1例为无MET扩增(FISH-);6例经NGS检测为非MET扩增(NGS-)的患者,FISH结果为MET扩增。总体来说,FISH对于MET扩增的检出率高于NGS(29.4% vs. 14.7%)。以FISH检测结果作为参照,NGS检测MET扩增的灵敏度为40%(4/10),特异性为95.8%(23/24),一致性为79.4%(27/34)。结果见表3。
表3.NGS与FISH结果的一致性
结论
该分析表明,相比于FISH,DNA NGS对于MET扩增的检出率低,特异性高但灵敏度相对较低,即可能会有一部分MET扩增的患者无法通过DNA NGS检出。
专家总结
EGFR-TKI治疗后耐药降低了EGFR突变晚期NSCLC患者长期生存,其中MET扩增已经成为EFGR-TKI耐药后重要的分子标志物,多项威廉亚洲博彩公司 共识推荐检测MET扩增。《非小细胞肺癌MET临床检测中国专家共识》指出,FISH是检测MET基因扩增的金标准。目前临床关注的重点在于对EGFR-TKI耐药的患者做到应检尽检,在实际的临床工作中发现,FISH对于TKI耐药后的MET扩增的检出率高于NGS,在一定程度上可弥补NGS漏检的不足,对于阴性NGS结果,必要时考虑FISH复测。
参考文献
1.Yu YF, et al. 2022 ESMO-Asia. Abstract 607.
2.Yang JH, et al. 2024 AACR. Abstract CT251.
3.NCCN威廉亚洲博彩公司 :非小细胞肺癌(2024.V5).
4.CSCO威廉亚洲博彩公司 :非小细胞肺癌(2024年版).
5.非小细胞肺癌MET临床检测中国专家共识(2022年版).
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