4月12日，国务院发布《政府工作报告》确定的重点工作，提出部门分工意见。其中国家卫生健康委员会参与15项工作，牵头推进健康中国战略实施。
实施健康中国战略
分工指出，由国家卫生健康委员会牵头，国家医疗保障局、国家药品监督管理局、国家中医药局等按职责分工负责，加大医护人员培养力度，加强全科医生、儿科医生队伍建设，推进分级诊疗和家庭医生签约服务。通过发展“互联网+医疗”、医联体等，把优质医疗资源下沉。继续提高基本公共卫生服务经费人均财政补助标准。坚持预防为主，加强重大疾病防控。改善妇幼保健服务。支持中医药事业传承创新发展。鼓励中西医结合。对境外已上市销售的药品，研究简化进口使用的审批手续，更好地保障群众用药可及。
国家卫健委同时负责，创新食品药品监管方式，注重用互联网、大数据等提升监管效能，加快实现全程留痕、信息可追溯。提高基本医保和大病保险保障水平，居民基本医保人均财政补助标准再增加40元，一半用于大病保险，让更多的人能够享受大病保险救助，扩大大病保险病种。扩大跨省异地就医直接结算范围，把基层医院和外出农民工、外来就业创业人员等全部纳入。
工作分工指出，国家卫健委还与多部门共同负责多项重大任务。
推进社会体制改革
深化公立医院综合改革，协调推进医疗价格、人事薪酬、药品流通、医保支付改革，提高医疗卫生服务质量，下大力气解决群众看病就医难题。深入推进教育、文化、体育等改革，充分释放社会领域巨大发展潜力。
发展壮大新动能
做大做强新兴产业集群，实施大数据发展行动，加强新一代人工智能研发应用，在医疗、养老、教育、文化、体育等多领域推进“互联网+”。
加强国家创新体系建设
强化基础研究、应用基础研究和原始创新，启动一批科技创新重大项目，高标准建设国家实验室。鼓励企业牵头实施重大科技项目，支持科研院所、高校与企业融通创新，加快创新成果转化应用。国家科技投入要向民生领域倾斜，加强雾霾治理研究，推进癌症等重大疾病防治攻关，使科技更好造福人民。
加大精准脱贫力度
深入推进产业、教育、健康、生态和文化等扶贫，补齐基础设施和公共服务短板，加强东西部扶贫协作和对口支援。对老年人、残疾人、重病患者等特定贫困人口，因户因人落实保障措施。
推动农村各项事业全面发展
完善农村医疗、教育、文化等公共服务。稳步开展农村人居环境整治三年行动，推进“厕所革命”和垃圾收集处理。
增强消费对经济发展的基础性作用
支持社会力量增加医疗、养老、教育、文化、体育等服务供给。
促进外商投资稳定增长
全面放开一般制造业，扩大电信、医疗、教育、养老、新能源汽车等领域开放。
稳步提高居民收入水平
提高个人所得税起征点，增加子女教育、大病医疗等专项费用扣除，合理减负，鼓励人民群众通过劳动增加收入、迈向富裕。
强化民生兜底保障
稳步提高城乡低保、社会救助、抚恤优待等标准。积极应对人口老龄化，发展居家、社区和互助式养老，推进医养结合，提高养老院服务质量。加强残疾人康复服务。健全社会救助体系，支持公益慈善事业发展。
打造共建共治共享社会治理格局
促进社会组织、专业社会工作、志愿服务健康发展。营造尊重妇女、关爱儿童、尊敬老人、爱护残疾人的良好风尚。
健全应急管理机制
推进突发事件应急体系建设“十三五”规划实施，加快预警信息发布系统和航空医学救援体系建设，强化综合应急保障能力。加强国际应急支援能力建设，提高国际应急支援水平。推动应急管理标准化建设，健全应急预案体系。加快应急产业发展，推进基层应急管理能力建设和应急管理科普宣教开展，提升社会协同应对能力。
此外，国家卫健委还将参与加快制造强国建设、发展公平而有质量的教育、创新信访工作方式等工作。
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