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NAR：基于人工智能技术在非编码DNA中发现新型癌症驱动突变
这项研究颠覆了人们对DNA的传统认识，将研究视角扩展到了之前被忽视的非编码区域。
NAR：港城大李帅成团队开发水平基因转移检测新算法，揭示肠道微生物水平基因转移和CRC的功能关联
研究团队开发了在肠道微生物中快速检测水平基因转移（HGT）的软件LocalHGT，并应用该软件揭示了HGT和疾病的功能关联，发现HGT作为生物标记可有效提高疾病预测准确率。
NAR：伯晓晨课题组基于可解释机器学习模型，探索转录因子调控的发育和演化规律
随着未来更多物种胚胎Hi-C数据的积累，TFCRs在跨物种早期胚胎中的转录调控机制及其在基因组三维构象的作用有待进行更详细的研究。
Nucleic Acids Res 上海九院张家毓/卞迁教授和第四军医大学马恒教授合作揭示端粒短缩在心肌细胞衰老中的重要作用
该研究发现端粒短缩可以在三维结构上调节心肌细胞染色质，上调端粒附近基因表达，并确定短端粒驱动心肌加速衰老的关键因素FOXC1，进一步揭示了端粒在非分裂心肌细胞中的作用。
学术交流｜黄羽薇：SIRT2去乙酰化激活DNA-PK以通过非同源末端连接促进DNA双链断裂修复
在本研究中，研究者揭示了通过SIRT2去乙酰化激活DNA-PK的调控步骤，该步骤可以促进DNA-PKcs定位到DSBs并与Ku相互作用，从而通过NHEJ促进DSB的修复。
NAR：华中师范大学闵金荣/刘珂团队揭示NRF1特异性DNA序列识别的分子机制
为了揭示识别机制，该研究测定了与ATGCGCATGCGCAT ds DNA结合的NRF1同源二聚体的晶体结构。
NAR：深圳国家基因库/华大生命科学研究院发表空间转录组学数据共享、分析和可视化综合数据库STOmicsDB
文章介绍了一站式空间转录组学数据库STOmicsDB，有助于空间转录组学领域的数据存档、共享、可视化和分析。
NAR：中山大学杨建华/屈良鹄团队发表RMBase v3.0平台：解码RNA修饰图谱、机制和功能
杨建华/屈良鹄团队对该平台再次进行了升级，发布了RNA修饰综合分析平台RMBase v3.0，可用于探索RNA修饰的转录组图谱、生物发生、相互作用组和功能。
Nucleic Acids Res：神母细胞瘤模型探究细胞周期进展与SWI/SNF活性作用
以神经母细胞瘤（Neuroblastoma）为模型探究细胞周期进展与 SWI/SNF ATP 酶活性之间的关系，揭示SWI/SNF活性在细胞周期G1-S转变中的关键作用。
NAR：哈工大/腾讯AI实验室合作构建迄今最大规模的单细胞蛋白质组数据库SPDB
哈尔滨工业大学研究团队联合腾讯人工智能实验室团队构建了一个全面的单细胞蛋白质组学数据库SPDB。
Sci Adv：DNA修饰检测新方法DARESOME，可同时分析单细胞和cfDNA中的多种DNA修饰
研究团队提出了一种基于限制性内切酶、可同时检测多种表观基因组状态的DNA分析方法“DARESOME”。
Nucleic Acids Research：李磊团队构建单细胞遗传调控平台解析疾病位点的细胞特异性机制
该研究整合了包括eQTLGen联盟，DICE项目和OneK1K在内的304个sc-eQTL数据集，涵盖了57种细胞类型和95种细胞状态，除了涉及外周血外，还囊括了脑和肺组织。
NAR发表端粒序列多样性综合数据库TeloBase，覆盖超9000个物种
研究团队创建了TeloBase数据库。该数据库包含9000多个物种的端粒序列，不仅提供交互式操作和数据可视化的图形，还允许基于用户的管理，避免了今后数据更新对管理员的过度依赖，以确保数据库更新的及时性
NAR：南开大学吕鑫屹团队发现Dot1l与Npm1协同抑制胚胎干细胞内源性逆转录病毒MERVL
该论文证实了Dot1l通过其AT-hook结构域与组蛋白伴侣Npm1相互作用，且Dot1l与Npm1共同定位在MERVL上，并通过组蛋白H1及其变体抑制mESCs中的MERVL和2CLC状态。
NAR：北京大学汤富酬团队利用单精子长读段基因组测序进行高精度单倍型分型
该研究开发了一种基于长读长的单精子基因组测序方法和相应的数据分析管道，可以准确地识别单个精子中的交叉事件和染色体水平的非整倍体，并有效地检测单个精子细胞中的SVs。
NAR：世界上首个基于荧光图像数据的单细胞多组学数据库——iSMOD
研究提供了一种统一多组学数据和技术的先进研究方法，开发了世界上首个基于图像的单细胞多组学数据库的综合浏览器——iSMOD。
NAR：李春权教授团队开发SEanalysis 2.0: 一个全面的人类和小鼠超级增强子调控网络分析工具
SEanalysis 2.0有助于更好地探索SE在疾病发生的分子机制和细胞生物学过程中的关键作用，协助研究人员更深入地了解SE。
NAR：李岩强/易旸等发现细胞身份基因的调控新机制
该论文揭示了一个“run-and-brake”模型，即细胞身份基因经历着频繁的转录和快速的RNA降解，以实现RNA表达的精确调控。
Nucleic Acids Res：南开大学吕万革/张雷发现KLF4通过协调特定的3D染色质结构抑制ESCs早期神经分化
KLF4 KO诱导mESC中3D 染色质结构的全局变化，包括拓扑相关结构域(TAD)中染色质相互作用的改变和增强子/启动子环的变化。
NAR：刘光慧/周园春/曲静/张维绮合作建立细胞谱系多组学数据库
总体而言，Lineage Landscape收集了超过660万个细胞的数据，包括1500万个差异表达基因条目信息。数据库将不断更新和整合不同组学层次的高质量数据集，从而为相关研究领域提供宝贵的资源。
