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Nucleic Acids Res：<font color="red">空间</font><font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>数据挖掘新算法——DeepST

Nucleic Acids Res：空间转录组学数据挖掘新算法——DeepST

研究团队研发了基于深度学习的空间域识别技术（DeepST）。DeepST使用预先训练好的深度神经网络模型从组织形态学信息（H&E染色图片）中提取图像特征，然后将提取的特征与基因表达和空间位置数据集成，

测序中国 - 数据挖掘，算法，空间转录组学 - 2022-10-24

Nat Biotechnol发表新<font color="red">空间</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>方法，同步实现<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>和代谢<font color="red">组</font>的<font color="red">空间</font>多模态精确分析

Nat Biotechnol发表新空间组学方法，同步实现转录组和代谢组的空间多模态精确分析

研究团队证明了在单个组织切片中结合SRT和MALDI-MSI并保留两种模式的特异性和敏感性的可能性，并在多巴胺和帕金森病条件下的小鼠和人类大脑样本中证明了该方法的潜力。

测序中国 - 空间多模态精确分析 - 2023-10-03

Nat Methods：基于测序的11种<font color="red">空间</font><font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>方法的系统比较

Nat Methods：基于测序的11种空间转录组学方法的系统比较

研究团队选择了一系列具有明确定义的组织结构特征的组织作为参考，使用其生成数据比较了11种sST方法。

测序中国 - 单细胞转录组测序，空间转录组技术 - 2024-08-03

Science：利用<font color="red">空间</font><font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>技术可视化观察组织中的基因表达

Science：利用空间转录组学技术可视化观察组织中的基因表达

在一项新的研究中，来自瑞典卡罗琳斯卡研究所和皇家理工学院等机构的研究人员开发出一种新的被称作空间转录组学（spatial transcriptomics）的高分辨率方法研究一种组织中哪些基因是有活性的

生物谷 Bioon.co - 转化医学，转录，RNA - 2016-07-04

<font color="red">空间</font><font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>方法EEL FISH：可实现高复用、高<font color="red">空间</font>通量和高分辨的原位单细胞分析

空间转录组学方法EEL FISH：可实现高复用、高空间通量和高分辨的原位单细胞分析

大脑是一个高度结构化的器官，包含多种细胞类型，具有复杂的空间模式组织。目前研究分析这些不同细胞类型之间的组织和空间关系仍具有挑战性。

测序中国 - 空间转录组学方法，高空间通量，高分辨的原位单细胞分析 - 2022-11-13

Nature：<font color="red">空间</font><font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>开辟记忆编码新视角：长期恐惧记忆的分子地图

Nature：空间转录组学开辟记忆编码新视角：长期恐惧记忆的分子地图

研究员通过高分辨率的空间和单细胞转录组学分析，研究者能够在分子和细胞层面上阐明BLA在长期记忆中的作用。

生物探索 - 长期记忆，BLA，空间转录组学 - 2024-02-13

eGastroenterology：基于<font color="red">空间</font><font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>揭示HBV及其与HDV和HIV共感染的生物<font color="red">学</font>特征

eGastroenterology：基于空间转录组学揭示HBV及其与HDV和HIV共感染的生物学特征

该研究首次利用空间转录组技术解析HBV及其与HDV和HIV共感染的生物学特征。

eGastroenterology - HIV，HBV，HDV，生物学特征 - 2024-08-06

Science：<font color="red">空间</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>技术概览与展望

Science：空间组学技术概览与展望

该综述系统地介绍了空间组学技术的丰富种类，阐明了其原理、优势和局限性，并就这一领域目前面临的挑战提供了观点和建议。

测序中国 - 空间组学 - 2023-08-26

<font color="red">空间</font><font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>新方法FISHnCHIPs可准确映射细胞类型

空间转录组学新方法FISHnCHIPs可准确映射细胞类型

研究团队提出了一种灵敏、稳健、可扩展的空间转录组学方法“FISHnCHIPs”，可对细胞类型和基因表达程序进行原位分析。

测序中国 - 空间转录组学，FISHnCHIPs - 2024-04-15

Mol Cancer：彭勇/姚晓军合作发表<font color="red">空间</font><font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>及其在癌症研究中的应用进展的综述

Mol Cancer：彭勇/姚晓军合作发表空间转录组学及其在癌症研究中的应用进展的综述

该文章概述了空间转录组学技术的发展、空间转录组学工具及其在癌症研究中的应用，并讨论了当前空间转录组学方法的局限性和挑战，以及未来的发展和前景。

iNature - 癌症研究，空间转录组学 - 2024-07-24

Acta Neuropathologica: 神经鞘瘤病的表观遗传<font color="red">学</font>、基因<font color="red">组</font><font color="red">学</font>和<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>

Acta Neuropathologica: 神经鞘瘤病的表观遗传学、基因组学和转录组学

神经鞘瘤病(SWNTS)是一种遗传性肿瘤易感综合征，是神经纤维瘤病的一种形式。

MedSci原创 - 神经鞘瘤病，LZTR1，基因组学 - 2020-10-13

Circulation：单细胞<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>揭示不同器官内皮细胞的<font color="red">转录</font>特征

Circulation：单细胞转录组学揭示不同器官内皮细胞的转录特征

虽然这些功能上的差异可能被记录在转录组中，但维持EC异质性的通路和网络尚未完全明确。

MedSci原创 - 内皮细胞，转录组，单细胞RNA测序 - 2020-09-19

NBT：上海交通大学杨朝勇/吴玲玲/宋佳/郑军华开发新的方法，实现高灵敏<font color="red">空间</font><font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>测序

NBT：上海交通大学杨朝勇/吴玲玲/宋佳/郑军华开发新的方法，实现高灵敏空间转录组学测序

该研究报道了一种用于空间RNA测序(Decoder-seq)的树状细胞DNA坐标条形码设计，该设计具有高灵敏度和高分辨率。

iNature - 测序，空间转录组学 - 2024-01-18

J Ethnopharmacol：代谢<font color="red">组</font><font color="red">学</font>结合<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>揭示瓜蒌薤白汤抗慢性心肌缺血机制

J Ethnopharmacol：代谢组学结合转录组学揭示瓜蒌薤白汤抗慢性心肌缺血机制

该研究通过代谢组学结合转录组学揭示瓜蒌薤白汤抗慢性心肌缺血机制。

MedSci原创 - 中医药，代谢组学，转录组学，慢性心肌缺血，瓜蒌薤白汤 - 2022-09-21

Nature Genetics：BANKSY：革命性算法，重塑<font color="red">空间</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>数据分析

Nature Genetics：BANKSY：革命性算法，重塑空间组学数据分析

该算法作为一种创新的空间组学数据分析工具，其主要功能是将空间组学数据中的细胞根据类型和组织域进行有效分类。

生物探索 - 空间组学，BANKSY - 2024-03-04

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